Polimorfismos SNPs asociados a receptores de mucosa gástrica y su efecto en la interacción con adhesinas de Helicobacter pylori de sujetos colombianos
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Palabras clave
Colonización
Proteínas receptoras
Genes de virulencia
Cáncer Gástrico
SNPs H. pylori
Colonization
Receptor proteins
Virulence genes
Gastric cancer
SNPs
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Resumen
Objetivo: Caracterizando polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) presentes en genes receptores de la mucosa gástrica y evaluando su interacción con adhesinas de Helicobacter pylori (H. pylori), es posible identificar una estrategia válida de bloqueo de su colonización y prevención del cáncer gástrico (CG) en Colombia. Materiales y Métodos: Se caracterizó SNPs asociados a tres receptores de mucosa gástrica: MUC5AC, PTPN11 y CEACAM3. Se incluyeron 63 exomas de individuos sin lesiones gástricas y 14 exomas de pacientes de Nariño con riesgo de CG e infectados por H. pylori. El análisis del efecto causal de las variantes se llevó a cabo mediante los programas de anotación PolyPhen-2, SIFT, MutationTaster, CADD y I-Mutant. Se incluyeron 235 secuencias de H. pylori para analizar los genes: babA, cagA y hopQ y un análisis de acoplamiento molecular en HDOCK. Resultados: Se identificaron 6/26 SNPs deletéreos en individuos sin lesiones gástricas. En los individuos con patologías gástricas e infectados con H. pylori se identificaron 2/5 SNPs deletéreos y 24/87 cambios de aminoácidos en las BabA; 42/87 en CagA y 21/87 en la HopQ. Conclusiones: Las variantes en la secuencia de aminoácidos de los factores de virulencia BabA, CagA y HopQ favorecen la interacción con proteínas receptoras de la mucosa gástrica MUC5AC, PTPN11 y CEACAM3, respectivamente. Los SNPs identificados inducen cambios de afinidad a nivel estructural y funcional favoreciendo la colonización de H. pylori, por tanto, se pueden considerar como posibles marcadores moleculares susceptibles de intervenir en la prevención del CG en Colombia.
Citas
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