Page 62 - Revista 2019

Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas
issn impreso 0120-4173, issn en línea 2500-7459
Abstract
Introduction: Colorectal cancer is a public health burden in the world and Colombia. Recent genome wide asso-
ciation studies have identifi ed chromosomal regions associated with the disease, depicting variable risk between
populations, owing to the demographic history and genetic ancestry. Objective: We aimed to study the colorectal
cancer risk in Colombia provided for 20 genetic markers, by using 955 cases and 972 controls from the CHIB-
CHA consortium, in the context of global and local genetic ancestry. Methodology: The samples were genotyped
using Axyom Affymetrix LAT and CUSTOME array in order to obtain the global genome genotypes including
20 risk SNPs. Statistical analysis was performed in PLINK (associations), ADMIXTURE (global ancestry), Elai
(local ancestry) and R language (logistic models). Results: Eleven chromosomal regions were associated with
ORs ranging between 1.14-1.41 (p<0.05): 18q21.1, 19q13.11, 10p14, 14q.2.2, 20p12.3, 8q23.3, 6p21.2, 15q13.3
y 8q24.21. On average, a higher global European ancestry was associated with colorectal cancer risk (OR=3.016,
IC 95%:1.162-7.894, p=0.00325). At the local chromosomal level two regions presented a signifi cant increment
of European ancestry 6q23.2 (OR adjusted=1.378, CI95%: 1.202-1.580, p adjusted =4.2e-6) and 4p13 (OR ad-
justed =1.301, CI95%:1.137-1.489; p adjusted =0.00013). Conclusions: Genetic ancestry can be considered as a
relevant factor for the colorectal cancer susceptibility in Colombia. Both Native American and European ancestry
are accounting for the most part of population structure in the sample we studied, which could explain the diffe-
rences for the colorectal cancer incidence between Latin American and European populations.

Keywords: genetic association study, SNPs, population, haplotype, genetic ancestry, genetic susceptibility.

Introducción: tinentales pueden deberse al efecto conjunto de facto-
res ambientales -determinados en parte por el estilo de
El cáncer colorrectal (CCR) es una de las malignidades vida y la historia demográfi ca- y genéticos, que generan

que se presentan con mayor frecuencia en el mundo; en patrones de gradientes geográfi cos en la incidencia (8).
términos del número de casos nuevos diagnosticados al Se estima que la contribución genética, correspondiente
año (1.6 millones para el 2013), y, en el efecto que tiene a la heredabilidad de la susceptibilidad al CCR, en los
la carga de dicho padecimiento en la sociedad, estimado casos con historia familiar, puede llegar a un 35% (Paul
como el número de años de vida ajustados por la en- Lichtenstein et al., 2000); que incluye aquellos loci con
fermedad (1-3). No obstante el avance en metodologías un bajo impacto individual en dicha heredabilidad (14).
para diagnóstico, tamizaje (4, 5), manejo operatorio y La mayoría de estas variantes han sido validadas y/o
oncológico (6), el CCR esta generando alrededor de replicadas en poblaciones caucásicas; pero con estudios
771.000 muertes al año (en 2013), representando cerca limitados en poblaciones mestizas como la colombiana.
de la mitad de todas las muertes causadas por cáncer El impacto que las variantes conocidas pueda tener en
gastrointestinal, siendo la probabilidad de desarrollarlo un trasfondo de mezcla genética, varia con la extensión
más alta en hombres que en mujeres (1:21 para hom- del desequilibrio de ligamiento -DL-, el mestizaje, y las
bres, 1:43 para mujeres) (7). A nivel mundial, el cáncer recombinaciones meióticas que han generado mosaicos
de colon y recto ocupa el tercer lugar en incidencia y el cromosómicos y nuevos haplotipos (15). La ancestría
cuarto en mortalidad; particularmente, en el caso de los genética, entendida como la proporción del genoma en
países desarrollados, es el segundo en ambos paráme- un individuo, que proviene de una o varias poblaciones
tros, mientras que en las naciones en vía de desarrollo ancestrales, genera un DL que es importante para ma-
ocupa el cuarto (8). La situación en Colombia refl eja pear variantes asociadas a enfermedades que muestran
en parte el panorama global de las transiciones socio- un riesgo diferencial debido a la ancestría genética, me-
demográfi cas en América Latina (9, 10), siguiendo un diante el mapeo de la mezcla (16), mostrando aplicabi-
incremento gradual entre 1985 y 2010 (11, 12), repre- lidad en poblaciones Latinas (17). Empleando esta me-
sentando la quinta causa de muerte por cáncer en ambos todología se han detectado loci de susceptibilidad para
sexos. A la fecha, no se implementan planes de tamiza- diferentes rasgos en poblaciones hispanas/latinas, tales
je, y la mortalidad es alta en áreas urbanas colombianas como la presión arterial (18), el asma (19) y cáncer de
debido al aumento de la incidencia y a los cambios en seno (20).
el estilo de vida en la población colombiana (12, 13).
Las diferencias observadas entre distintas regiones con- Entre distintas poblaciones continentales existen varia-

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Rev. Asoc. Col. Cienc.(Col.), 2019; 31: 61-72