Page 64 - Revista 2019

Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas
issn impreso 0120-4173, issn en línea 2500-7459
Ancestría local. Se calculó la ancestría local en los existe una mayor proporción nativa americana en las
22 autosomas usando ELAI (26). Las simulaciones se poblaciones de Pasto, Bogotá y Neiva, mientras que es
desarrollaron empleando poblaciones de referencia de baja en ciudades del eje cafetero y Medellín.
África, Europa y nativos americanos, usando como pa-
rámetros el número de generaciones desde que ocurrió A nivel global, la ancestría amerindia fue signifi cati-
la mezcla genética (y=20) y, el número de poblaciones vamente mayor en controles (x ̅ =0.39 ±0.13) compa-
parentales a considerar (S=3). El análisis de los resulta- rada con los casos (x ̅ =0.37±0.126) (U de Mann-whit-
dos se realizó en lenguaje de R, mediante modelos de ney, p=0.0001621). La proporción ancestral europea
regresión logística para asociar la proporción ancestral también fue signifi cativamente diferente (U Mann-
por locus con el riesgo al CCR y mapear las regiones Whitney, p=0.0003423), siendo mayor en los casos
cromosómicas signifi cativas (p < 10E-5), usando las ba- (x ̅ =0.550±0.13) que en los controles (x ̅ = 0.527 ±0.13)
ses de datos (Genome Browser y ENSAMBL). (Fig. 1). La ancestría africana fue del ~8% (d.s= 0.09)
en casos y controles, con diferencias signifi cativas entre
Resultados. los dos grupos comparados (p=0.00016). El componen-
te nativo y el europeo fueron los de mayor proporción,
Estudios previos del grupo han defi nido las característi- mientras que la africana fue baja, pues el 75% de los
cas demográfi cas, clínicas y patológicas de la muestras individuos presentaron menos de un 10% de esta ances-
empleadas en el presente estudio (27). tría en promedio.
Ancestría global en casos de CCR y en los controles. A nivel de ciudad, las diferencias entre casos y contro-

En la tabla 1 se presentan las proporciones ancestrales les no son homogéneas, existen algunas donde las va-
en casos y controles de cada ciudad muestreada (tabla riaciones son más pronunciadas en unas que en otras;
1). Los casos y los controles presentaron principalmente pero en general, aquellos donde las ancestrías nativas
ancestrías amerindia y europea, con variación amplia en o europeas fueron las más altas, es donde existe signifi -
cada ciudad. El componente africano fue alto (>10%) cancia en las diferencias de las medias.
en algunas poblaciones: Medellín y Cali. En general,

Tabla 1. Proporciones de ancestría nativas americanas europeas y africanas en los casos y controles (media±d.s), de acuerdo
con la ciudad donde se captó la muestra.
Grupo Ciudad NAM EUR AFR
Bogotá 0,431±0,116 0,515±0,104 0,054±0,073

Bucaramanga 0,405±0,071 0,561±0,074 0,034±0,028
Cali 0,391±0,162 0,421±0,166 0,188±0,233
Ibagué 0,406±0,102 0,535±0,104 0,059±0,065
Controles
Medellín 0,296±0,108 0,601±0,137 0,103±0,087
Manizales 0,360±0,196 0,563±0,191 0,077±0,071
Neiva 0,435±0,111 0,518±0,107 0,046±0,023
Pasto 0,575±0,152 0,392±0,140 0,033±0,085
Bogotá 0,423±0,094 0,525±0,093 0,052±0,075
Bucaramanga 0,371±0,110 0,583±0,117 0,046±0,072
Cali 0,383±0,126 0,436±0,144 0,181±0,208
Casos
Ibagué 0,402±0,106 0,537±0,108 0,061±0,069
Medellín 0,263±0,097 0,635±0,141 0,102±0,089
Manizales 0,288±0,159 0,667±0,190 0,045±0,055
Neiva 0,411±0,114 0,533±0,118 0,055±0,036
Pasto 0,481±0,130 0,481±0,121 0,038±0,043
Ancestrías: NAM, nativas americanas; EUR europeas y (AFR africanas.
Relación entre la ancestría genética global y el riesgo al CCR. Se aplicó un modelo de regresión logística para
la asociación entre las ancestrías europea/nativa y el CCR.

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Rev. Asoc. Col. Cienc.(Col.), 2019; 31: 61-72