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Variantes de MPS en Colombia. Moreno  et al




                 Abstract

                 Introduction: Mucopolysaccharidoses (MPS) are lysosomal storage diseases characterized by the excessive ac-
                 cumulation of glycosaminoglycan sulfate (GAGs) in organs and tissues, due to the alteration in the genes that
                 code for enzymes involved in the lysosomal degradation of glycosaminoglycans. Seven different types of MPS
                 disorders (I, II, III, IV, VI, VII, and IX) are recognized with 11 specifi c lysosomal enzyme defi ciencies. Colom-
                 bia does not have exact data on the burden of the disease, nor data on the allelic frequency that allows knowing
                 the presence of population variants and possible affected individuals and carriers. Objective: To determine the
                 population allelic frequency of the variants of the MPS complex in a population without a clinical and molecular
                 diagnosis of this pathology. Materials and methods: An observational descriptive study was carried out where
                 the allelic frequency of variants present in the IDUA, IDS, SGSH, NAGLU, HGSNAT, GNS, GALNS, GLB1,
                 ARSB, GUSB, HYAL1 genes associated with MPS was determined by means of the sequencing of 320 exomes
                 from patients without a clinical diagnosis of MPS from the Southwest of Colombia; the results were tabulated and
                 allelic frequency formulas were used to determine the values associated with each of the genes. Results: 509 alle-
                 les associated with the MPS complex were reported, of which 262 have not been previously reported. The genes
                 with the most frequent allelic presence were IDUA, GLB1 and GALNS, involved in MPS I and MPS IV A. These
                 studies allow us to know the population frequency of each of the variants associated with the MPS complex,
                 which facilitates the timely identifi cation of possible patients and carriers, and to carry out timely interventions
                 that also include genetic counseling. Conclusions: With the advancement in genomic diagnostic methods, it is
                 possible to expand the knowledge about the impact of the presence of variants of the genes associated with the
                 MPS complex in our population, identifi cation and establishment of comprehensive programs that bring us closer
                 to precision medicine.

                 Keywords: Computational Biology, Exome sequencing, Mucopolysaccharidosis Complex, Lysosomal Storage
                 Diseases, Allelic Frequency (DeCS)



            INTRODUCCION                                       En  Colombia,  los  estudios  realizados  por  Gómez  et
            El complejo de mucopolisacaridosis (MPS) es un grupo  al (2012), estimaron  que la frecuencia combinada de
            de enfermedades huérfanas –raras, de baja prevalencia,  todos los casos de MPS es de 1,98 casos por 100.000
            caracterizadas por la defi ciencia de enzimas que partici-  nacidos vivos, siendo la de tipo IV la de mayor frecuen-
            pan en el metabolismo de glucosaminoglicanos (GAGs)  cia con 0,68 casos por 100.000 nacidos vivos; además
            a nivel lisosomal (1). Se caracteriza por acumulación  propusieron  una  incidencia  de  0,45:100.000  (NV)  en
            de GAG intracelular, produciendo alteraciones de múl-  pacientes con MPS I, 0,17:100.000 (NV) en MPS III,
            tiples órganos y sistemas. La   presentación   clínica    0,68:100.000  (NV)  en  MPS  IVA,  0,23:100.000  (NV)
            en   pacientes   con   MPS   incluye afectación multi-  en pacientes con MPS VI, no se reportaron incidencias
            sistémica, principalmente el hígado, el bazo, el SNC,  para MPS VII y MPS IX.  Determinaron también que
            hueso, cartílagos, ojos y al almacenarse en cantidades  la MPS IVA o síndrome de Morquio A, en Colombia
            excesivas se presentan problemas en el desarrollo, anor-  tiene una frecuencia de 0,68 casos por 100,000 nacidos
            malidades esqueléticas, mielopatíaía cervical y compre-  vivos, datos hasta el 2012, siendo la MPS con mayor
            sión medular, defectos en el sistema inmune y neural y  frecuencia en la población colombiana (6)
            muerte a una edad temprana  ( 2, 3 )
                                                               Con base en el boletín epidemiologico 05 del 27 de fe-
            Se reconocen siete tipos distintos de trastornos de MPS  brero al 2 de febrero de 2019 en Colombia, informó que
            (I, II, III, IV, VI, VII y IX) con 11 defi ciencias especí-  específi camente la prevalencia de MPS IV se presenta-
            fi cas de enzimas lisosomales. Todos los tipos de MPS  ba con un tamaño de muestra de aproximadamente 150
            tienen un tipo de herencia autosómico recesivo, excep-  pacientes,  correspondientes  a  0,3:100.000  habitantes.
            to el MPS II (síndrome de Hunter), recesivo ligado al  Por su parte, para el periodo epidemiológico IV de 2020
            cromosoma X y, por lo tanto, afecta principalmente a  la proporción de notifi cación de MPS II fue de 7 casos
            los varones (4). En general la prevalencia es de 1,04 a  (0,15%) y MPS VI 6 casos (0,13%)(7,8)
            4,8/100,000 nacidos vivos con variación en cada país,
            la región o el origen étnico(5)                    En Colombia, se hace difícil el cálculo de la frecuen-
                                                                                                            125
            Rev. Asoc. Col. Cienc.(Col.), 2020; 32: 124-142
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