Page 102 - Revista 2019

Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas
issn impreso 0120-4173, issn en línea 2500-7459
de tía fallecida a los 21 años secundario a infarto al terísticas de interacciones proteína – proteína.
miocardio repentino, tíos abuelos fallecidos de manera
súbita antes de los 50 años y prima hermana con taqui- Resultados
cardia sinusal; no se identifi caron en el paciente otros
antecedentes patológicos de importancia. El estudio de biología molecular realizado permitió,
mediante la técnica de secuenciación exómica comple-
Estudios Moleculares. Se realizó estudio de biología ta, la identifi cación de 4 variantes patogénicas en 3 ge-
molecular mediante la técnica de secuenciación de exo- nes asociados a cardiopatías; gen PKP2 ubicado en la
ma completo, a partir del uso de secuenciador masivo de región cromosómica 12p11.21, gen CACNB2 el cual se
TM
última generación, NovaSeq6000 System (Illumina), ubica en la región cromosómica 10p12.33-p12.31 y gen
TM
en bibliotecas Nextera , con cobertura de 100X y una TTN ubicado en la región cromosómica 2q31.2, en el
lectura total de 678910 variantes de secuencia; alinea- cual se identifi caron dos variantes.
miento con genoma de referencia GRCh38/hg19, con el
objetivo de identifi car variantes incluídas en regiones El análisis computacional permitió la caracteriza-
exónicas, intrónicas o regiones de splicing, incluyendo ción de las variantes identifi cadas, la primera variante
mutaciones de cambio de sentido o sin sentido, sinóni- c.236G>A (p.Arg79Gln) en el gen PKP2, variante pre-
mas, pequeñas inserciones o deleciones, en alguno de viamente registrada en la literatura, la cual se asocia a
los genes asociados a cardiopatías. Displasia arritmogénica del ventrículo derecho 9.

Estudio Computacional. El análisis bioinformático de En el gen CACNB2, se logró identifi car la variante
las variantes obtenidas a partir del estudio de biología c.120+65G>C, la cual no se encuentra reportada pre-
molecular se realizó utilizando diferentes bases de datos viamente en la literatura, pero cuya variación se asocia
específi cas y diferentes softwares de predicción de exo- al síndrome de Brugada tipo 4.
nes; entre las que se incluyó bases de ClinVar, MedGen,
HGMD, OMIM, GenViewer, CRAVAT y softwares Finalmente, se caracterizó en el gen TTN, dos va-
como Exac, Provean, SIFT (Sorting Intolerant From riantes no reportadas previamente en la literatu-
Tolerant), Polyphen, Mutation Taster, UMD-Predictor, ra, c.7991_7993del (p.Asn2664del) y c.33569T>C
Exome Variant Server y LOVD, utilizando la clasifi ca- (p.Ile11190Thr), las cuales, se encuentran asociadas a
ción recomendada por la ACMG, a través de las cuales la miopatía de Salih, a la cardiomiopatía familiar hi-

se pudo analizar las variantes encontradas, analizar la pertrófi ca tipo 9 y a la cardiomiopatía dilatada tipo 1G
secuencia y la estructura de los genes implicados, la (Tabla 1).
anotación funcional de los genes candidatos, las carac-

Tabla 1. Genes identifi cados por estudio de biología molecular asociados a cardiopatías congénitas.
Gen Mutación Cambio de Aminoácido Patología Asociada
PKP2 c.236G>A p.(Arg79Gln) Displasia arritmogénica del ventrículo derecho 9 (AD)
CACNB2 c.120+6G>C - Síndrome de Brugada 4 (AD)
TTN c.7991_7993del p.(Asn2664del) Miopatía de Salih (AR), Cardiomiopatía hipertrófi ca
familiar 9 (AD), Cardiomiopatía dilatada 1G (AD).
TTN c.33569T>C p.(Ile11190Thr) Miopatía de Salih (AR), Cardiomiopatía hipertrófi ca
familiar 9 (AD), Cardiomiopatía dilatada 1G (AD).

Utilizando la base de datos del sistema de predicción de interacciones funcionales de genes obtenidos GeneMA-
NIA, se evaluó las redes de expresión de interacciones físicas, co-expresión, predicción, rutas, co-localización,
interacciones genéticas, dominios proteicos, encontrándose asociación – interacción. Tabla 2, fi gura 1

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Rev. Asoc. Col. Cienc.(Col.), 2019; 31: 100-105