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Variantes del gen GBA en el Suroccidente Colombiano. Arturo-Terranova et al

ción de glucosilceramida en órganos viscerales genera, El análisis de la secuencia obtenida se realizó con el
en el 90% de los pacientes, esplenomegalia y, entre el programa bioinformático SeqScape Software v3 (Ter-
60-80% de los afectados con la enfermedad, hepato- moFisher Scientifi c) y la anotación de las variantes ob-
megalia. Como consecuencia de esto, resulta frecuente tenidas se desarrolló con programa Alamut VisualTM
la disminución de la concentración de glóbulos rojos (Interactive Biosoftware). La identifi cación de las va-
y trombocitopenia. (7). La EG2 y EG3 se asocia con riantes de interés se realizó con respecto del genoma de
afectación neurológica que pueden llegar a ser graves. referencia (hg19).

Tradicionalmente, el diagnóstico se ha realizado me- Bases de datos.
diante un examen clínico acompañado del estudio Las bases de datos de referencia utilizadas fueron bases
bioquímico midiendo los niveles de la actividad de la de datos poblacionales dbSNP, 1000genomes, EXAC
enzima B-Glucocerebrosidasa en los leucocitos de san- y gnomAD, las bases de datos clínicas Human Gene
gre periférica, esta se considera el Gold standar como Mutation Database (HGMD versión 2019.4) ClinVar y
prueba diagnóstica ya que los hallazgos histopatológi- LOVD, bases específi cas de la enfermedad, si procede,
cos en el hígado, bazo o médula ósea no siempre son y algunas bases propias de Reference Laboratory Ge-
confi ables, además de representar procedimientos muy netics.
invasivos (8). Sin embargo, los estudios enzimáticos no
permiten la distinción entre los individuos sanos y los Análisis bioinformático.
portadores; es por esta razón que hoy en día se está rea- El análisis bioinformático para evaluar el posible im-
lizando un análisis de variantes especifi cas al gen de in- pacto de las variantes de interés en la estructura y fun-
terés o adoptando el uso de técnicas moleculares como cionalidad de la proteína fue llevado a cabo con los pro-
la secuenciación del exoma completo para efectos de gramas bioinformáticos Mutation Taster, SIFT, Human
asociaciones fenotipo-genotipo y un conocimiento más Splicing Finder, UMD-Predictor, Provean, SNPeffect,
amplio sobre las variantes asociadas a la enfermedad SNPs3D y PolyPhen2 para predecir el impacto en la
(8,9). En cuanto al tratamiento, hoy en día se encuen- proteína de sustituciones de aminoácidos. La Clasifi ca-
tran disponibles abordajes terapéuticos como la terapia ción de las variantes se realizó con base a las recomen-
de reemplazo enzimático, la terapia farmacológica de daciones del American College of Medical Genetics
chaperonas, el trasplante de medula ósea, el uso de oli- and Genomics (ACMG) (10).
gonucleótidos anti sentido y la terapia génica experi-
mental. Red de interacción.
Finalmente se realizó una red de interacción génica del
Este estudio tiene como objetivo caracterizar molecu- gen GBA por medio del programa GeneMania para de-
larmente las variantes del gen GBA en pacientes del Su- terminar asociaciones cercanas con otros genes que per-
roccidente Colombiano con diagnóstico de enfermedad mitieran determinar interacciones físicas o niveles de
de Gaucher coexpresión.

METODOLOGÍA Aspectos bioéticos.
Tipo de estudio. Protección de personas y animales: Los autores decla-
Estudio observacional, descriptivo, transversal y pros- ran que los procedimientos seguidos se conformaron a
pectivo, en el que se incluyeron 19 pacientes del suroc- las normas éticas de comité de experimentación huma-
cidente colombiano diagnosticados clínica y enzimá- na responsable y se adapta a los principios establecidos
ticamente con enfermedad de Gaucher, que aceptaron en la Declaración de Helsinki de la Asociación Médica
participar en el estudio, previo consentimiento informa- Mundial (AMM); el nivel de esta investigación se
do. ha categorizado como riesgo mínimo, ya que presenta
un riesgo muy bajo de daño físico al participante
Toma de muestra. al tratarse de un estudio retrospectivo de revisión de
Para la identifi cación de las variantes en cada paciente, resultados.
se tomaron previamente muestras de sangre periférica
que fueron enviadas para realizar la respectiva secuen- Confi dencialidad de los datos: Los autores declaran que
ciación de los fragmentos amplifi cados con el secuen- en este artículo no aparecen datos de pacientes y han
ciador automático ABI3130 (Applied Biosystems). seguido los protocolos de su centro de trabajo.

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Rev. Asoc. Col. Cienc.(Col.), 2020; 32: 115-123.