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Avistamientos de aves y bioinformática para la enseñanza en Choachí. Bernal et al.

Para el análisis bioinformático se seleccionó un grupo der la fi logenia en animales. (29-31, Tabla 1).
de interés de colibríes del género Amazilia, los cuales
se han tomado de referencia ya que son observados Posteriormente se realizó un análisis progresivo o ali-
por habitantes en los bosques andinos de la zona alta neamiento múltiple donde se varía los GP de una mane-
de la vereda Ferralarada. Se exportaron 32 secuencias ra específi ca de secuencia y posición, lo que ayuda a ali-
en formato FASTA(Tabla 1). Y una secuencia del grupo near secuencias de diferente longitud y similitud; esto
externo cercano que corresponde al género Thalurania. permite una alineación progresiva con las secuencias en
Se determinó un solo marcador molecular: Cytochrome pares (28, 32). La interfaz utilizada fue Evolutionary
Oxidase Subunit 1 (COI) (28). El cual constituye uno de Genetics Analysis, MEGA. (33, Figura 2).
los marcadores mayormente utilizados para compren-

Figura 2. Resultado alineamiento múltiple utilizando ClustalW (32).
Nota: Resultado de alineamiento múltiple utilizando ClustalW y visualizado por medio de la interfaz de MEGA (33).

Se realizó la edición del alineamiento en Notepad++ cluye los caracteres no informativos (599 caracteres)
(34). Para modifi car los espacios entre nombres y otros que impiden un rápido análisis (Figura 3A). Por medio
caracteres como símbolos. Ya que esto impide importar la pestaña Heuristics, se modifi caron los parámetros
la secuencia a través de otras plataformas. Finalmente, para permitir resultados robustos. Maximun tres to keep
dicho alineamiento fue importado por medio de la in- 10000, Number of replications 30, Starting Trees per
terfaz ASADO (35). Para el análisis de parsimonia se rep 5 (35, Figura 3B).
realizó una selección de todas las secuencias y se ex-

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Rev. Asoc. Col. Cienc.(Col.), 2020; 32: 171-182